Biofilmi-isäntä -vuorovaikutus kroonisessa tulehduksessa
Yhteystiedot
Riikka Ihalin
riikka.ihalin[at]utu.fi
Jäsenet
Ryhmän johtaja: Riikka Ihalin, FT, Dos.
Vanhempi tutkija: Marja Pöllänen, HLT, EHL
Tohtoritutkija: Heidi Tuominen, FT
Projektitutkija: Annamari Paino, FM
Pro-gradu työntekijä: Tuuli Ahlstrand, fil.yo
Vaihto-opiskelija: Indre Navickaite
Taustaa
Monet bakteerit kasvavat luonnollisessa ympäristössään yhdyskuntina, biofilmeinä, joissa niitä ympäröi suojaava mm. polysakkarideista ja DNA:sta rakentunut soluväliaines. Ihmisissä nämä biofilmit aiheuttavat kroonisia tulehduksia, jotka ovat merkittävä haaste niissä maissa, missä rokotusohjelmat ja tehokkaat antibiootit ovat vähentäneet akuuttien bakteeritulehdusten haittoja. Biofilmit ovat vastustuskykyisiä isännän puolustusvasteelle ja antibiooteille niitä ympäröivän soluväliaineen ja muuttuneen metabolian johdosta. On myös esitetty, että biofilmien bakteerit pystyisivät hyödyntämään isännän tuottamia tulehduksen välittäjäaineita, joiden ensisijaisena tehtävänä isännän kannalta on tehostaa bakteerien hävittämistä.
Tutkimus
Tutkimme biofilmi-isäntä -vuorovaikutusta kroonisessa tulehduksessa käyttäen mallibakteerina Aggregatibacter actinomycetemcomitansia (Aa), joka on tärkein aggressiivisen parodontiitin (hampaan kiinnityskudoksen tulehdus) opportunistisista patogeeneistä. Tutkimuksemme painottuu Aa:n molekyylimikrobiologiaan, ja erityisesti miten sen ulkokalvon proteiinit ovat osallisena tulehdusvasteen aistimisessa. Käytämme tutkimuksissa molekyylibiologian ja rakennebiologian menetelmiä, virtaussytometriaa sekä elektroni- ja atomivoimamikroskopiaa. Lisäksi tutkimme isännän vastetta Aa-biofilmille ien-hammasliitosta matkivassa kudosviljelymallissa.
Julkaisut:
Paino A., Lohermaa E., Korhonen J., Sormunen R., Tuominen H., Pöllänen M.T., Ihalin R. (2012) Interleukin-1beta is internalised by viable Aggregatibacter actinomycetemcomitans biofilm and binds to the outer edges of nucleoids. Cytokine; 60: 565-574.
Pöllänen M.T., Laine M.A., Ihalin R., Uitto V.-J. (2012) Host-Bacteria Crosstalk at the Dentogingival Junction. Int J Dent; 2012: Article ID 821383, 14 pages.
Tarry M., Jääskeläinen M., Paino A., Tuominen H., Ihalin R., Högbom M. (2011) The extra-membranous domains of the competence protein HofQ show DNA-binding, flexibility and a shared fold with type-I KH-domains. J Mol Biol; 409: 642-653.
Paino A., Tuominen H., Jääskeläinen M., Alanko J., Nuutila J., Asikainen S., Pelliniemi L.J., Pöllänen M.T., Chen C., Ihalin R. (2011) Trimeric Form of Intracellular ATP Synthase Subunit β of Aggregatibacter actinomycetemcomitans Binds Human Interleukin-1β. PLoS ONE 6(4): e18929.